NVIDIA は、コロナウイルスとの戦いに取り組む研究者に Parabricks ツールを無料で提供すると発表しました。この解析ソフトウェアは、同社のGPUを使用して1時間以内にヒトゲノムの完全な配列を実行することができる。
ブログでの発表によると、NVIDIA は本日、このツールをゲノム解析キットの一部として利用できるようにしました。コロナウイルスの分析に取り組んでいる研究者は、 90日間の無料ライセンスを使用できるようになりますが、同社は必要に応じてこの期間を延長できると明記しています。
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新型コロナウイルス感染症(COVID-19)のパンデミックにより、研究センターはコロナウイルスがどのように広がるのかを理解するために、コロナウイルスと影響を受けた人々のゲノムの配列を解析することに重点を置いている。 NVIDIA が提供するツールは、高性能 GPU を利用してプロセスを高速化します。
唯一の欠点は、無料ライセンスにはハードウェア パッケージが含まれていないため、研究者は何らかのクラウド ソリューションを使用する必要があることです。エヌビディアによると。 GPU を使用すると、ゲノム配列の解析が最大 50 倍高速化される可能性があります。
前例のないパンデミックの蔓延を考慮すると、数日ではなく数時間で結果が得られることは、ウイルスの進化の理解とワクチンの開発に大きな影響を与える可能性があります。
Parabricks は、数か月前に NVIDIA のヘルス部門で買収されました。このツールは、人工知能とハイパフォーマンス コンピューティング アプリケーションに焦点を当てた GPU アクセラレーション ライブラリである CUDA-X で構築されています。買収に先立って、このアメリカの新興企業は、完全なゲノムを分析するプロセスを1 時間以内に加速できるソリューションを開発しました。
NVIDIA に加えて、 Intel や Lenovoなどの企業も数週間前、ペタバイト規模の遺伝情報の分析に必要なハードウェアを北京ゲノミクス研究所に提供する提携を発表しました。スーパーコンピューターは、コロナウイルスの感染パターン、宿主と病原体の相互作用、毒性の調査に役立つだろう。
参考資料一覧
- https://blogs.nvidia.com/blog/2020/03/19/coronavirus-research-parabricks/
- https://www.nvidia.com/en-us/industries/healthcare-life-sciences/
