南アフリカで検出された新型コロナウイルス感染症（COVID-19）のオミクロン変異種について私たちが知っていること

新型コロナウイルス感染症（COVID-19）を引き起こすオミクロンと呼ばれるコロナウイルスの新たな変異株が南アフリカで確認されており、デルタを含む他の変異株にも多数の変異が存在する。現在B.1.1.529 と呼ばれている亜種は、国内で急速に広まっているようです。これらは、ゲノム監視の専門家であるスペインの研究者4人の素早い反応です。

新型コロナウイルス（COVID-19）の配列決定とゲノム監視のスペインの専門家3名が、国際的な信頼できる情報ポータル「Covid-19ワクチンメディアハブ」への声明の中で、南アフリカで検出された新たな変異株に関する一連の質問に答えている。スペイン語ノードです。彼らは、住民に不安を与えることなく、その進化を監視することが重要であることに同意している。

新型コロナウイルス感染症 (Omicron) の新しい変異種 Omicron について何がわかっていますか?

イニャキ・コマス

SeqCovid-Spain コンソーシアムの共同ディレクター、バレンシア生物医学研究所 (IBV) CSIC 研究者

とりあえず、少しだけ。一方で、スパイクには多数の突然変異が蓄積され、その中にはより高い感染力に関連していると考えられるものや、抗体の有効性の低下に関連しているものもあります。ただし、二人が一緒にいるところを見ることはないので、本当にそうなのかどうかはわかりません。この目的を達成するために、新型コロナウイルス感染症のオミクロン変異株の抗体に対する反応が類似しているか否かを判断できる実験がすでに実施されており、並行してその疫学的な増殖率も調査されている。デルタよりも伝達率が高いか低いかがわかります。

これまでのところ南アフリカでデルタに代わって急速な成長が見られているという事実は、必ずしも感染力の点で有利であることを示しているわけではない

現在、南アフリカでデルタ変種に代わって急速に増殖しているという事実は、必ずしも感染力の点で有利であることを示しているわけではありません。私たちは南アフリカでそれがどのような道をたどるのか、そして何よりも他の国と比較して、それが居場所を見つけるかどうかを見るのを待たなければなりません。たとえば、ベータ版は当時私たちが非常に懸念していたものでしたが、南アフリカを越えて広がることはありませんでした。

したがって、疫学的状況（ワクチン接種、症例の増加または減少など）が異なる国でそれがどのような軌跡をたどるかを確認する必要があります。南アフリカでは迅速識別検査が使用されていることは事実であり（ゲノム配列決定には時間がかかります）、アフリカが位置する地域では急速に感染が拡大しているようです。

マリア・イグレシアス・カバレロ

カルロス 3 世保健研究所、国立微生物学センター、インフルエンザおよび呼吸器ウイルス参照研究室の研究員

新型コロナウイルス感染症（COVID-19）のオミクロン変異株は今月ボツワナで検出されており、その棘が獲得した多数の変化により特に関連性が高まっている。これは南アフリカでの感染者の増加に関連しており、ハウテン州でPCRによって検出された感染者の90％はこの変異種によるものである可能性があると推定されている。ダーバンの疫病対応・イノベーションセンター所長であるトゥリオ・デ・オリベイラ氏が発表したものによると、2週間も経たないうちに同州でこれまで大部分を占めていたデルタ変異種に取って代わり、このウイルスが主要な循環系統となったという。

フェルナンド・ゴンサレス・カンデラス

遺伝学の教授。 SeqCovid-Spain コンソーシアムの共同ディレクター。 FISABIO-Universitat de Valencia 研究員

これは、ウイルスの循環が非常に少なく、ワクチン接種を受けていない人口が多い地域での流行に関連したコロナウイルスの変異種です。この変異種は直ちに不釣り合いに増加しているように見えます。なぜなら、感染爆発に関連しており、検査で陽性反応が出たほとんどすべての症例がこの変異種に関連しており、その相対頻度が即座に非常に高いためです。それが明らかにその成長率を驚異的なものにしている。

これは、ウイルスの循環が非常に少なく、ワクチン接種を受けていない人口が多い地域での流行に関連したコロナウイルスの変異種です。

一方で、これを忘れてはなりませんが、これまで見てきた変異体よりもはるかに多くの変異があるのも事実です。 Sタンパク質だけでも、スパイク部分には、元の武漢ウイルスと比較してすでに32個の変異が存在する。さらに、スパイク内のこれらの変異の多くは、これまでにも懸念対象の変異体や注目の変異体で見られていたが、言い方を変えれば、それらの多くが単一のゲノムにまとめられたのはこれが初めてである。

まだ明らかではなく、信頼できるデータを得るには時間がかかるだろうが、これらすべての変異の蓄積が本当に感染力を高める効果があるのか​​、ワクチン免疫や以前の感染による免疫から逃れる可能性があるのか​​、それともより毒性が強いのかということである。そして感染した人の経過はさらに悪化します。これらすべてに関するデータはなく、現時点で私たちにできることは推測することだけです。

フランシスコ・ディエス・フエルテ

カルロス 3 世保健研究所国立微生物センター研究員

新型コロナウイルス感染症 B.1.1.529 系統の Omicron 亜種について評価するにはまだ時期尚早です。アルファ変異体やデルタ変異体など、注目され懸念されている他の変異体で見つかっているスパイクタンパク質の変異が多くあるのは事実で、一部の研究では、より大きな伝達能力や抗体に対する異なる反応の可能性と関連付けられています。中和剤を使用していますが、監視とさらなるデータを待つ必要があります。

ECDC はすでにこの変異種を関心のある変異体として認識していますが、欧州連合における疫学的な影響に基づいて懸念される変異体としての指定の評価を待っています。

Omicron の亜種には特別な注意が必要ですか?

イニャキ・コマス

重要なことは、世界中でこれらの潜在的な脅威を特定し、追跡し、評価する能力を持つことです。

はい、彼はそれに値します。それは、私たちがそれが何をするかを知っているためではなく、現時点ではほんのわずかですが、私たちが見ている突然変異の組み合わせが持つ可能性のためです。私たちはそれらの多くを、懸念される他の亜種でも見てきました。したがって、私たちは警戒主義に陥ることなく、それに従い、数か月前のデルタのようなシナリオに陥っていないか、それとも誤報なのかを確認する必要があります。

重要なことは、世界中でこれらの潜在的な脅威を特定し、追跡し、評価する能力を持つことです。コロナウイルスの変異種の大部分は何も存在しないが、デルタのような一部の変異種が以前の変異種に取って代わり、疫学的な制御が少し難しくなっている。

いずれにせよ、今まで以上に、予防は複数の層に基づいており、それらはすべて不完全ですが、一緒にすると非常に効果的であることを忘れないでください。私たちが持っている最も優れた層はワクチンですが、デルタでは感染を十分に阻止できないことがわかっています。ただし、マスク、距離、換気を追加すると、これが発生します。そしてその教訓は、過去、現在、未来のあらゆるバリエーションに当てはまります。

マリア・イグレシアス・カバレロ

私の意見では、新型コロナウイルス感染症のオミクロン変異種の流行を監視し、その変化を特徴付けることが重要です。記載されている多数の変化の中には、N440K や S477N 変化など、受容体に対する親和性を向上させる可能性のある変化、つまり活性に影響を与える可能性のある変化が含まれているため、スパイクにおけるこの一連の変化の表現型の特徴付けは非常に重要です。 E484A、T478K、Q493K の変化などの中和抗体の変化、および N679K の変化など、タンパク質のプロセシングとその結果としての伝達に影響を与える可能性のある変化そしてP681H。したがって、この変化の組み合わせの表現型研究は、その実際の影響を知るために非常に重要です。

より良いデータセットが得られるまでは、ワクチンの伝播や予防について主張するのは手ぬるいものになるだろう。

疫学上もウイルス学上も、より良いデータセットが得られるまでは、ワクチンの伝播や防御について厳密に発言することは難しいだろうが、監視システムに従事する私たちにとっては、新たな変異株の出現には最大限の注意を払う価値がある。 . そして仕事。

フェルナンド・ゴンサレス・カンデラス

はい、それは注目に値しますが、それだけです。注目してください。私たちは、この変異種の新型コロナウイルス感染症がより多くの環境でどうなるのか、また、他の国に感染した場合に何が起こるのかを確認する必要があります。そのためには監視する必要がありますが、監視することと警戒することは別のことです。この状況には警報が必要ではなく、他の亜種で以前に行われていたのと同様の監視が必要であるようです。

ワクチンは引き続き高い有効性を維持します。時間の経過とともにワクチンの有効性が低下し、そのため追加免疫の投与量が減少することを我々は見てきましたが、この変異種ではそれが異なることは期待できません。したがって、監視はしますが、警告はしないでください。

既知のことを踏まえると、新型コロナウイルス感染症ワクチンの有効性に影響を与える可能性はあるでしょうか?

イニャキ・コマス

まだわかりませんが、その意味で最も懸念される変異のいくつかを他の変異体で以前に確認しましたが、すべての変異の組み合わせ、つまり特定の変異体でどのように組み合わされるかがその動作を決定することもわかっています。 。

新型コロナウイルス感染症（COVID-19）のオミクロン変異体の一部の変異が、抗体による中和を低下させることはわかっています。なぜなら、それは以前にも見たことがあるからです。それは良いニュースではありませんが、免疫応答は、私たち全員が経験している細胞応答を含め、抗体によって媒介されるものよりもはるかに複雑です。しかし、それは簡単ではないため、めったに測定されません。

私たちが知っていることは、一部の変異を持った変異体は有効性をわずかに低下させるものの、大きくは低下させず、入院や死亡に対しては依然として十分な保護があったということです。

マリア・イグレシアス・カバレロ

この変異種がワクチン接種を受けた人々に及ぼす影響を示すためには、血清学的研究が必要である

このコロナウイルス変異種がワクチン接種を受けた人々に及ぼす影響を示すためには、血清学的研究が必要である。理論的には、この一連の変更はワクチンによる防御に影響を与える可能性があります。さらに、ファイザー社、ヤンセン社、アストラゼネカ社による完全なレジメンを接種した一部のワクチンにおいて、この変異株への感染が報告されています。現実には、現時点では調査対象のサンプルが少ないため、この点に関する完全な情報は得られていません。

フェルナンド・ゴンサレス・カンデラス

私たちが知っている限りでは、それが影響を与える可能性があるという証拠はありません。特定の抗体の中和能力を低下させるいくつかの変異があることはわかっていますが、ワクチンは単一の抗体の生成を引き起こすのではなく、むしろ多数の抗体（おそらく数十個）の生成を引き起こします。

ウイルスのオミクロン変異体には、人がワクチン接種されたときに生成されるすべての抗体を同時に回避する能力があるとは思えません。確かに減少していますが、ワクチン接種を受けているにもかかわらず、この変異種に感染した人の重篤な発生率が増加すると考えなければならないほどではありません。これは、変異株が発生した場合に警戒する必要がないという意味ではありません。 、この望ましくない逸脱を修正するために必要な制御手段、再ワクチン接種または新しいワクチンの製剤を講じます。